Биология in silico - Журнал "Компьютерра"

24 мая 2012 года

Биология in silico

Автор: Михаил Гельфанд
Опубликовано в журнале "Компьютерра" №36 от 21 сентября 2001 года

Страница 2 из 2. Вернуться на первую страницу.

Словарь

ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) - полимерная молекула, элементарными единицами которой являются четыре нуклеотида: A, C, G, T. Ген - участок ДНК, кодирующий один белок. Белок - полимер, в построении которого принимают участие 20 аминокислот (на самом деле больше, но другие аминокислоты появляются в результате дополнительной химической модификации). Белки играют основную роль в жизни клетки - формируют ее скелет, катализируют химические реакции, выполняют регуляторные и транспортные функции. В живой клетке каждая молекула белка имеет сложную пространственную структуру (см. рис. 1).

Рис. 1. Схема биосинтеза белка.

Рис. 1. Схема биосинтеза белка.

РНК-полимераза синтезирует РНКовую копию (мРНК) фрагмента ДНК (транскрипция). Рибосома транслирует мРНК и осуществляет синтез белка, присоединяя аминокислоты в соответствии с таблицей генетического кода (см. рис. 1 к следующей статье). Затем белок сворачивается в пространственную структуру (об этом подробнее см. в КТ #398).

Геном - совокупность всех генов организма или, шире, полная последовательность ДНК. Размер генома человека - 3 миллиарда нуклеотидов, кодирующих 35-40 тысяч генов ¹, генома бактерий - от 600 тысяч нуклеотидов/600 генов (внутриклеточные паразиты) до 6-8 миллионов нуклеотидов/5-6 тысяч генов (свободно живущие бактерии). Упражнение: в скольких выпусках журнала «Компьютерра» можно будет опубликовать бактериальный геном, если посвящать этому половину каждого номера?

Секвенирование - определение последовательности нуклеотидов во фрагменте ДНК. Именно это имеется в виду, когда в газетах пишут о «расшифровке генома человека». Исследование работы генов в масштабе целых организмов, а также эволюция геномов составляют предмет геномики, а анализ полного набора белков в клетке и их взаимодействий друг с другом - предмет протеомики ².

1 (обратно к тексту) - А вовсе не сто тысяч, как ожидалось первоначально, ср. «КТ» № 370, i37034.
2 (обратно к тексту) - Иногда говорят о «постгеномной эре». Как правило, в эту фразу не вкладывается никакого разумного смысла, и она носит чисто политический характер, связанный с перераспределением финансирования научных исследований. На самом деле все новые и крайне важные направления вырастают именно из анализа геномной информации, которая и служит фундаментом для дальнейших разработок. Более того, мы только лишь начинаем понимать устройство генома в целом. (См. также «КТ» № 412, Е. Каликинская, «Протеомика против геномики». Л. Л.-М.)

<<1

версия для печати другие статьи автора оставить комментарий (0)
ТАКЖЕ В РАЗДЕЛЕ 24 февраля 2009 года Не отрываясь 24 февраля 2009 года Жилец вершин 10 февраля 2009 года Гаджеты, которых нет 10 февраля 2009 года Схватка 10 февраля 2009 года Мобильный телефон 2015 года 10 февраля 2009 года Список задач		MARKETGID Загрузка...