Федеральная налоговая служба направила претензии более чем пятидесяти российским ИТ-компаниям в связи с применением налоговых преференций. Предметом разбирательств стал переход организаций на отраслевые льготы для аккредитованных ИТ-предприятий в том же налоговом периоде, когда они утратили право на льготы как резиденты фонда «Сколково».
По информации юристов и налоговых консультантов, спор касается ситуаций, когда компания в течение одного календарного года лишалась статуса участника проекта «Сколково» и затем пыталась использовать пониженные ставки по налогу на прибыль и страховым взносам, предусмотренные для организаций из реестра Минцифры.
Позиция ФНС заключается в том, что налоговый период по налогу на прибыль составляет один год, и смена режима налогообложения внутри этого периода не допускается. Ведомство считает неправомерным последовательное или параллельное применение двух различных мер господдержки к одной налоговой базе в пределах одного отчетного года. По мнению контролирующих органов, это фактически приводит к дублированию льгот и их суммированию, что не предусмотрено действующим законодательством.
Претензии были предъявлены по результатам налоговых периодов 2023, 2024 и 2025 годов.
В Федеральной налоговой службе пояснили, что до 2026 года у компаний, обладавших одновременно статусом резидента «Сколково» и аккредитованной ИТ-организации, была возможность выбирать наиболее выгодный режим налогообложения при условии отсутствия прочих нарушений.
Однако в настоящий момент подход ужесточен: более пятидесяти крупных и средних предприятий получили уведомления с требованиями о доначислениях. Конкретный перечень компаний не раскрывается.
В случае если позиция налоговых органов будет признана обоснованной, компаниям грозит перерасчет налога на прибыль исходя из стандартной ставки за весь спорный период. Кроме того, законодательство предусматривает начисление пеней за каждый день просрочки и штрафов за неполную уплату налогов. Эксперты отмечают, что итоговые суммы доначислений могут оказаться значительными, и не исключают, что часть дел будет передана в арбитражные суды.
К урегулированию вопроса подключилось Министерство цифрового развития, связи и массовых коммуникаций. Ведомство участвует в обсуждении сложившейся правовой коллизии и пытается выработать единую трактовку норм налогового законодательства. Ожидается, что позиция регуляторов может быть уточнена в ближайшее время, что повлияет на дальнейшее развитие этой практики и возможные разъяснения для участников рынка.